技術(shù)服務(wù) 抗體測序服務(wù)

艾柏森生物科技有限公司作為值得信賴的抗體研發(fā)服務(wù)供應(yīng)商，擁有專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊，可為客戶提供的抗體測序服務(wù)。艾柏森生物打造的全新一代抗體測序平臺，基于蔦槍法與抗體數(shù)據(jù)庫相結(jié)合的技術(shù)“Database Assisted Shotgun Sequencing”（DASS）技術(shù)，這項技術(shù)還適用于其他亞型和不同形式的抗體，如：IGM，熒光偶聯(lián)抗體，固定化抗體，不同物種的抗體等。

等重氨基酸測序

與其它基于MS測序方法不同的是，我們可以分辨大多數(shù)等重氨基酸復(fù)合物

★ W可與GE、AD、SV區(qū)分

★ R可從GV中區(qū)別出來

★ Q可從GA、K中區(qū)別出來

★ N可從GG中區(qū)別出來

Figure 1.Workflow of Service

運(yùn)用DASS技術(shù)對V、J、C片段測序

　　目前已有的一些數(shù)據(jù)庫（如NCBI）雖包含抗體V、J、C片段序列，但是在抗體成熟的過程中，一個B細(xì)胞中的抗體基因要經(jīng)過體細(xì)胞突變的過程才會產(chǎn)生高親和力的成熟抗體。

　　我們采用*的計算方法，并能匹配相應(yīng)物種的突變肽段，保證每條肽段都會被檢測到，且每一個氨基酸位點(diǎn)都會生成20-7-條MS/MS光譜，對難測序的proline和arginine的肽段也可實現(xiàn)測序。

Figure 2.Sequence coverage is verified with the integrity of the combination of multipleLC-MS/MS datasets

CDR3區(qū)測序

　　抗體輕鏈的CDR3去多由胚系基因編碼，而重鏈的CDR3區(qū)則由D基因編碼，D基因大部分區(qū)域由于受到核酸酶及末端轉(zhuǎn)移酶等重組酶的作用而發(fā)生基因重排，導(dǎo)致抗體重鏈CDR區(qū)在數(shù)據(jù)庫中無法進(jìn)行同源對比，而只能對其進(jìn)行de novo測序。高質(zhì)量的質(zhì)譜數(shù)據(jù)與高效率的數(shù)據(jù)挖掘算法的結(jié)合，使我們對抗體CDR3區(qū)域的解讀更為有力，我們可以測得數(shù)據(jù)庫中無同源序列的20kDa的蛋白質(zhì)。